Đối với một thành phố cảng, văn minh và hiện đại thì không thể thiếu các tiêu chí để bảo vệ môi trường. Nhận thức rõ được điều này, công ty luôn cập nhật các vấn đề liên quan tới xây dựng nhà máy xanh, giảm thải, tiết kiệm năng lượng… Đồng thời, thực hiện đầy đủ các quy định về xử lý chất thải, hạn chế tối đa các sự cố xảy ra; vận hành tốt trang thiết bị, bảo đảm thực hiện tiết kiệm trong chi phí nhiên liệu, giảm thiểu chất thải, tiếng ồn và bụi bặm; lắp đặt bổ sung các thiết bị dự phòng; khẩn trương có dự án xử lý chất thải rắn; trồng bổ sung cây xanh; phối hợp xử lý các tồn tại về đất đai, di chuyển các công trình, trường học chịu ảnh hưởng vì sự hoạt động của nhà máy; phối hợp với các ngành, địa phương xử lý các vấn đề liên quan tới bảo đảm an sinh xã hội… ông Nguyễn Thường Quang - Tổng giám đốc công ty - cho biết: hàng năm công ty thực hiện quan trắc, giám sát môi trường theo cam kết và thuê Trung tâm Quan trắc môi trường (thuộc Sở Tài nguyên và Môi trường TP. Hải Phòng) phân tích định kỳ môi trường của nhà máy với tần suất 3 tháng/lần. Đối với việc quản lý khí thải: lựa chọn, sử dụng thiết bị công nghệ tiên tiến, lắp đặt hệ thống lọc bụi và khử lưu huỳnh trong khí thải, bảo đảm việc phát thải ra ngoài theo đúng mức quy định cho phép. Khí thải, ống khói luôn được giám sát bởi hệ thống quan trắc tự động, theo dõi liên tục để có biện pháp điều chỉnh kịp thời khi các thông số ô nhiễm có nguy cơ vượt ngưỡng.
Đối với việc quản lý nước thải, bao gồm nước thải công nghiệp và nước thải sinh hoạt được thu gom và xử lý theo một chu trình kín, nước sau xử lý có các thông số đạt yêu cầu theo quy chuẩn kỹ thuật quốc gia và được tái sử dụng để vận hành hệ thống thải xỉ, bảo đảm không thải ra ngoài môi trường. Về quản lý chất thải nguy hại, nhà máy có ít chủng loại, nhưng thường xuyên phát sinh do công tác bảo trì, bảo dưỡng thiết bị. Các chất thải nguy hại như giẻ nhiễm dầu, nước nhiễm dầu, sáp mỡ đã qua sử dụng được thu gom và lưu giữ tại kho chất thải nguy hại, sau đó chuyển giao cho đơn vị xử lý đúng như quy định pháp luật.
Việc quản lý dầu FO, UBND TP. Hải Phòng đã phê duyệt Kế hoạch ứng phó sự cố tràn dầu của công ty. Công ty tổ chức thường niên lớp huấn luyện và diễn tập cho đội ứng cứu khẩn cấp, tạo ý thức thường trực của cán bộ, công nhân viên trong việc ứng cứu sự cố cũng như bảo vệ môi trường. Hàng năm, công ty đốt một lượng than khoảng 3,4 triệu tấn. Than được nhập về qua cầu cảng và vận chuyển bằng hệ thống băng tải kín và được hệ thống phun sương dập bụi ở khu vực cảng và kho chứa bảo đảm môi trường không khí không bị ô nhiễm.
Trong khuôn viên nhà máy, luôn chú trọng trồng cây xanh với diện tích phủ xanh khoảng 12ha (20% diện tích) và trồng cây phi lao làm hàng rào viền ngăn bụi tại khu vực cảng than, kho chứa than và hồ thải xỉ. Nhân dịp tết hàng năm, công ty phát động tết trồng cây, trồng thêm cây tại các khu vực trong và ngoài nhà máy với lượng trồng 200 - 300 cây mỗi năm. Đồng thời, bảo vệ môi trường chung, tham gia thường xuyên công tác giữ gìn vệ sinh môi trường sống xung quanh cùng chính quyền địa phương để môi trường thêm xanh - sạch - đẹp.