Theo đó, về công tác xây dựng, tổ chức thực hiện quy hoạch du lịch, kết quả thanh tra cho thấy UBND tỉnh Quảng Namlập quy hoạch điều chỉnh kéo dài (từ năm 2003 đến năm 2009 mới hoàn thành); chưa thực hiện đầy đủ việc thông báo quy hoạch theo quy định, việc phê duyệt quy hoạch điều chỉnh tổng thể phát triển du lịch chưa có ý kiến của Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch. Thực hiện chưa đạt các chỉ tiêu quy hoạch đề ra về lượt khách tham quan lưu trú, thu nhập xã hội từ du lịch, cơ sở lưu trú, lao động và việc làm.

Về chấp hành chính sách pháp luật của doanh nghiệp kinh doanh du lịch về dịch vụ lữ hành, lưu trú, phần lớn các doanh nghiệp thực hiện nghiêm túc những quy định của Luật Du lịch và các văn bản hướng dẫn. Tuy nhiên cũng có không ít doanh nghiệp, cá nhân chấp hành chưa nghiêm, còn vi phạm các quy định của pháp luật về kinh doanh du lịch, gây những khó khăn nhất định trong công tác quản lý doanh nghiệp kinh doanh du lịch của cơ quan nhà nước, gây ảnh hưởng đến môi trường kinh doanh, ảnh hưởng đến hình ảnh của địa phương. Nhân sự trong công tác thanh tra, kiểm tra, hậu kiểm 3 còn mỏng so với nhu cầu thực tế, nên chưa thể kiểm soát và xử lý triệt để các doanh nghiệp vi phạm các quy định của ngành du lịch trong quá trình kinh doanh.

Về chấp hành chính sách, pháp luật trong thực hiện dự án đầu tư phát triển du lịch; đa số các dự án chậm tiến độ, chậm hoàn thành việc xây dựng các hạng mục đã được phê duyệt mặc dù đã được cơ quan có thẩm quyền cho cam kết, gia hạn tiến độ thực hiện dự án. Việc thực hiện chính sách, pháp luật tại một số dự án còn để xảy ra khuyết điểm, vi phạm. Cụ thể, thanh tra phát hiện tại Quảng Nam có các dự án gồm: Dự án Công viên văn hoá chủ đề Ấn tượng Hội An do Công ty Cổ phần Gami Hội An làm nhà đầu tư; Dự án Sân gôn Indochina Hội An do Công ty cổ phần sân gôn Indochina Hội An làm nhà đầu tư; Dự án Khu du lịch nghỉ dưỡng và sân gôn cao cấp Mai House Hội An; Dự án đầu tư xây dựng Công viên khu B tại phường Cẩm An, thành phố Hội An, tỉnh Quảng Nam.

Tổng thanh tra Chính phủ kiến nghỉ Thủ tướng chính phủ chỉ đạo chấn chỉ về công tác quản lý, đề nghị UBND tỉnh Quảng Nam chỉ đạo UBND thành phố Hội An bổ sung Dự án Công viên văn hoá chủ đề “Ấn tượng Hội An” vào kế hoạch sử dụng đất và quy hoạch sử dụng đất của thành phố. Trình HĐND tỉnh bổ sung Dự án Công viên văn hoá chủ đề “Ấn tượng Hội An” vào danh mục cần thu hồi đất và chuyển mục đích sử dụng đất của tỉnh đảm bảo đúng quy định của Luật Đất đai năm 2013.

Kiểm tra, rà soát trình tự thủ tục phê duyệt chủ trương đầu tư, kế hoạch sử dụng đất, việc thực hiện dự án, thực hiện quy hoạch của Dự án đầu tư xây dựng Công viên khu B tại phường Cẩm An, thành phố Hội An, đặc biệt là công trình "Khu dịch vụ - Thương mại của công viên biển khu B" do Công ty Cổ phần Du lịch Dịch vụ và Đầu tư xây dựng Hội An làm chủ đầu tư. Trường hợp có vi phạm thì xử lý nghiêm theo quy định của pháp luật. Yêu cầu chủ đầu tư điều chỉnh 07 hạng 25 mục công trình của dự án (khách sạn, 04 nhà nghỉ độc lập, quầy tiếp tân, khu trị liệu) theo đúng mục tiêu quy hoạch là dịch vụ - thương mại của công viên, phục vụ công cộng trong công viên; đồng thời chấm dứt ngay việc gộp 07 hạng mục công trình nêu trên vào Dự án Khu du lịch Trendy (Boutique Resort Hội An) để hoạt động kinh doanh lưu trú du lịch không đúng mục đích quy hoạch của khu đất.

Đồng thời xử lý về kinh tế, UBND tỉnh Quảng Nam cần chỉ đạo Cục thuế tỉnh Quảng Nam ban hành thông báo mới (thay thế Thông báo số 6770/TB-CT ngày 07/11/2014 của Cục thuế tỉnh Quảng Nam) cho Công ty Cổ phần Sân gôn Indochina Hội An biết về thời gian khấu trừ 14.995,346 triệu đồng tiền bồi thường, hỗ trợ về đất vào tiền thuê đất phải nộp hàng năm tương đương 5 năm 5 tháng (được tính từ tháng 11/2007 đến hết tháng 3/2013). Từ tháng 4/2013, Công ty Cổ phần sân gôn Indochina Hội An bắt đầu phải nộp tiền thuê đất theo quy định. Từ đó thực hiện truy thu số tiền thuê đất phải nộp nhưng chưa nộp là 41.987,039 triệu đồng (giai đoạn tháng 4/2013 đến hết tháng 12/2018) từ Công ty Cổ phần Sân gôn Indochina Hội An nộp về Cục thuế tỉnh Quảng Nam; xác định và thu số tiền chậm nộp (nếu có) đảm bảo không thất thoát ngân sách nhà nước. Đồng thời ban hành Thông báo tiền thuê đất và thực hiện thu tiền thuê đất của Công ty Cổ phần Sân gôn Indochina Hội An từ tháng 01/2019 trở về sau theo đúng quy định, đảm bảo không thất thoát tiền ngân sách nhà nước.

Ngoài ra, UBND tỉnh Quảng Nam phải tổ chức kiểm điểm, xác định và xử lý nghiêm trách nhiệm của cá nhân, tập thể có liên quan theo quy định của pháp luật đối với các vi phạm: Xác định không đúng số lượng lao động thường xuyên giai đoạn 2008-2013 của Công ty cổ phần Sân gôn Indochina Hội An dẫn đến tính sai thời gian phải nộp tiền thuê đất, tính sai số tiền thuê đất phải nộp, làm thất thu ngân sách nhà nước. Để xảy ra việc sử dụng đất không đúng mục tiêu quy hoạch của công trình "Khu dịch vụ - Thương mại của công viên biển khu B" do Công ty cổ phần Du lịch Dịch vụ và Đầu tư xây dựng Hội An làm chủ đầu tư.